Okulumuz, ilimizin ilk Anadolu Lisesi olarak Milli Eğitim Gençlik ve Spor Bakanlığı Ortaöğretim Genel Müdürlüğünün 26/08/1984 tarihli ve 40469 sayılı onayı ile Muğla Orman Başmüdürlüğü Makine Eğitim Merkezi binasında yetmiş iki (72) öğrenci ile eğitim öğretime başlamıştır. Hizmet binasının temeli Muğla Anadolu Lisesi Okul Koruma Derneği tarafından 27/12/1988 tarihinde atılmış, devlet-vatandaş işbirliği ile tamamlanarak 07/04/1992 yılında kendi binasına taşınmıştır.
Ortaöğretim Genel Müdürlüğü'nün 24/12/2018 tarihli ve 24864139 sayılı onayı ile 2015 yılında terörle mücadelede şehit düşen 2008 yılı mezunumuz Jandarma Teğmen Altuğ PEK'in adını alan okulumuz, başarılarıyla taçlandırdığı bir maziye sahip olmanın haklı gururu ve sorumluluğu ile eğitim öğretim çalışmalarını sürdürmektedir
Değişen ve gelişen şartlara bağlı olarak anlayışını ve ilkelerini her zaman güncelleyen okulumuz alanında yetkin, deneyimli, çalışkan, gelişime açık, etik ve çözüm odaklı bir eğitim kadrosu ile yeni nesillerin hayâl dünyalarını, yaratıcılıklarını ve keşfetme duygularını geliştiren, okul yaşantısını ve öğrenmeyi keyifli hâle getiren, mutlu, özgüvenli, başarılı, araştıran, sorgulayan, iletişim becerileri gelişmiş, akademik başarı ile birlikte bilim, kültür, sanat ve spor alanlarında da başarılı bireyler yetiştirmeyi hedeflemektedir.
